НБУ здійснює ліцензування і нагляд за банками. Паралельно з банківським наглядом НБУ також здійснює попередню кваліфікацію осіб, зацікавлених у придбанні неплатоспроможних банків. Також НБУ делегує двох представників до адміністративної ради Фонду (керівний орган Фонду).
Після виявлення проблем у банку НБУ має право віднести банк до категорії проблемних. Тоді Фонд розпочинає підготовку до виведення його з ринку. Проте не всі проблемні банку зазнають банкрутства. Такі банківські установи можуть покращити свій стан і за рішенням НБУ повернутись до звичайної діяльності.
Якщо ж проблемний банк продовжує порушувати законодавство, то рішення про неплатоспроможність установи приймається НБУ самостійно. НБУ може запросити Фонд на засідання, коли розглядається питання неплатоспроможності банку, проте Фонд не має права голосу при розгляді такого рішення.
У разі визнання банку неплатоспроможним Фонд запроваджує в ньому тимчасову адміністрацію, тобто відсторонює керівництво і бере банк під повний свій контроль.
У разі необхідності виведення з ринку системно важливого банку НБУ направляє Кабінету Міністрів України пропозицію щодо участі держави у врегулюванні.
Після отримання рішення НБУ про неплатоспроможність інформація про стан банку стає публічною і Фонд оголошує відкритий конкурс. В рамках конкурсу отримані Фондом конкурсні пропозиції від потенційних учасників конкурсу направляються до НБУ для перевірки фінансового стану учасника конкурсу: чи має потенційний покупець 100% акцій достатньо власних коштів для інвестиції або чи зможе потенційний приймаючий банк обслуговувати передані вклади. На конкурсі розглядаються тільки конкурсні пропозиції учасників, які отримали позитивний висновок НБУ.
В встановлених законом випадках НБУ, який має функцію ліцензування, надає згоду на створення Фондом перехідного банку та погоджує його статутні документи. НБУ також погоджує придбання переможцем-інвестором 100% акцій неплатоспроможного банку або перехідного банку, створеного Фондом на його базі. Після продажу акцій інвестору НБУ погоджує збільшення статутного капіталу неплатоспроможного або перехідного банку, призначення інвестором керівників банку та перевіряє, чи виконав інвестор зобов’язання щодо оздоровлення банку.
